merenlab/anvio

master

anvio

Grade	Name	Complexity	Churn	Issues
A	anvio\workflows\conda_envs\nanoplot.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\multiqc.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\minimap2.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\metaspades.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\megahit.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\idba_ud.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\flye.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\filtlong.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\fastqc.yaml		1	-
A	anvio\workflows\conda_envs\bowtie.yaml		1	-
A	anvio\workflows\__init__.py	189	10	9
A	anvio\version.py	0	12	-
D	anvio\variabilityops.py	409	8	25
A	anvio\variability.py	45	5	-
F	anvio\utils.py	812	21	52
A	anvio\ttycolors.py	2	3	-
F	anvio\trnaseq.py	1088	9	22
A	anvio\trnaidentifier.py	220	5	4
A	anvio\topologicallayout.py	119	2	1
A	anvio\threadingops.py	41	2	-