2lambda123/cbioportal

master

cbioportal

Grade	Name	Complexity	Churn	Issues
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\stats\BenjaminiHochbergFDR.java	6	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\stats\FisherExact.java	55	1	2
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\stats\OddsRatio.java	21	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\AccessControl.java	3	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CacheUtil.java	3	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CancerStudyReader.java	20	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CancerStudyTagsReader.java	2	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CascadeSortOfMatrix.java	27	1	3
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CategoryLabelReader.java	8	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\ClinicalReader.java	6	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CnaUtil.java	19	4	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\CoExpUtil.java	16	1	1
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\ConsoleUtil.java	37	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\ConvertProfileDataToGeneticEvents.java	6	1	2
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\DataSetsUtil.java	13	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\DatabaseProperties.java	19	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\DebugHrrsFilter.java	9	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\Direction.java		1	1
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\DoubleUtil.java	4	1	-
A	core\src\main\java\org\mskcc\cbio\portal\util\DynamicState.java	5	1	-